构成变造公司债券罪的，行为人会被处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处一万元以上十万元以下罚金；如果变造的债券数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处二万元以上二十万元以下罚金。
如果是单位构成了此罪的，处罚为，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员处以上述刑罚。
【法律依据】
《刑法》第一百七十八条，伪造、变造股票或者公司、企业债券，数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处一万元以上十万元以下罚金；数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处二万元以上二十万元以下罚金。
单位犯前两款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照前两款的规定处罚。