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由Jesse Polhemus,计算机科学系的沟通和拓展专家
凭借190万美元的基因组创新者奖(Genomic Innovator Award), Ritambhara Singh将利用机器学习更好地理解疾病的遗传基础。
普罗维登斯,罗德岛[布朗大学]- Ritambhara Singh,布朗大学计算机科学助理教授,是11个研究国家之一nwide将获得国家颁发的2021年基因组创新者奖人类基因组研究所。
作为美国国立卫生研究院(National Institutes of Health)的一部分,该研究所设立了这个奖项,以支持那些在职业生涯早期并在团队科学努力中发挥关键作用的基因组学研究人员的创新工作。辛格的奖金总计190万美元,将支持她开发机器学习方法以揭示疾病中的基因调控机制的工作。
辛格是布朗大学计算分子生物学中心的一名成员,他说:“我很高兴能够继续和扩大我们在实验室的数据集成工作。”“在大数据时代,结合不同类型的基因组数据集,为我们提供重要的生物学见解,是一项具有挑战性的任务,我们非常渴望在实验室中解决。”
99热点资讯Singh在该奖项下的研究美的热水器服务热线电话将解决基因调控研究中的基本问题,特别是揭示调控机制在理解疾病遗传基础中的重要性。
辛格说:“我们目前对基因调控的理解类似于解决拼图游戏。”“虽然已经确定了许多控制基因表达的因素,但这些‘部分’是如何拼凑成一个整体发挥作用的仍不清楚。”我的研究已经在基因组数据集上开发并应用了最先进的机器学习方法,试图将这些数据片段组合在一起。”
她的建议的主要目标包括:
应用和细化深度学习体系结构,捕捉复杂数据集和公司的底层结构 把它们连接到基因上 压力;开发这些模型的解释方法,以特别挑选出疾病细胞系中与失调基因相关的信号;扩展这些f 单细胞数据集的框架以了解单细胞分辨率的基因调控。Singh说:“我们的努力将导致深度学习框架,整合信息并产生可解释的结果,捕捉基因调控如何在广泛的细胞群和单细胞规模上受到影响。”“这是我认为基因组学未来的最终目标之一,也就是简化信息流程,从基因组数据收集工作到我们对疾病的理解,再到临床应用。我希望我们继续建立合作,利用方法创新来实现这一目标。”
今年是基因组创新者奖(Genomic Innovator Award)的第三年,该奖项支持的研究人员的工作跨越基因组学的各个领域,包括基因编辑技术、大脑相关疾病、单细胞基因组学和精准医学。与资助严格界定的研究项目的更传统的资助不同,该奖项为研究人员提供了在广阔的科学领域内以灵活的方式追求创新研究方向的灵活性。