医疗事故鉴定的程序是：
1、由专家鉴定组的组长主持鉴定；
2、双方当事人陈述意见和理由；
3、专家鉴定组成员提问和现场检查；
4、当事人退场；
5、专家鉴定组进行讨论；
6、经合议后，形成鉴定结论。
【法律依据】
《医疗事故技术鉴定暂行办法》第三十三条，鉴定由专家鉴定组组长主持，并按照以下程序进行：
(一)双方当事人在规定的时间内分别陈述意见和理由。陈述顺序先患方，后医疗机构；
(二)专家鉴定组成员根据需要可以提问，当事人应当如实回答。必要时，可以对患者进行现场医学检查；
(三)双方当事人退场；
(四)专家鉴定组对双方当事人提供的书面材料、陈述及答辩等进行讨论；
(五)经合议，根据半数以上专家鉴定组成员的一致意见形成鉴定结论。专家鉴定组成员在鉴定结论上签名。专家鉴定组成员对鉴定结论的不同意见，应当予以注明。