职工医保跟农村医保的区别如下：
一、职工医疗保险的适用对象是单位职工，而农村医保参保对象主要是当地的村民。
二、职工医保的缴费主体是用人单位和劳动者本人；农村医保的缴费主体是参保人本人集体和政府多方筹资。
三、新农合在农村乡镇医院的报销比例最高，到市级以上医院报销比例相对社保较少。职工医保一般在定点医院看病报销比例最高，其它医院报销比例会降低。
【法律依据】
《社会保险法》第二十三条，职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。
无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费。