本罪与生产、销售不符合卫生标准的食品罪的界限
1、犯罪手段不同。前者生产、销售的食品中掺入有毒、有害的非食品原料，后者生产、销笛的食品不符合卫生标准。如果掺入的物质有毒害性，但其本身是食品原料，其毒害性由于该食品原料污染或腐败变质引起的，造成严重危害结果的、按生产、销售不符合卫生标准的食品罪论处。
2、对危害结果的要求不同。生产、销售有毒、有害食品罪是行为犯，实施该行为即构成犯罪;生产、销售不符合卫生标准的食品罪是危险犯，只有存在足以造成了严重食物中毒事故或者其他严重食源性疾患的才构成犯罪。
本罪与投毒罪的界限
投毒罪有故意与过失两种。本罪与故意投毒罪的区别关键在于犯罪目的不同：故意投毒罪的目的是使不特定多数人死亡或伤害，直接危害公共安全，而本罪的目的多为牟利，虽然行为人对掺入有毒、有害的非食品原料是明知的，但并不追求危害结果的发生，行为人对引起危害公共安全的后果只能是间接故意。与过失投毒罪的区别关键在于对在食品中掺入有毒、有害的非食品原料的主观心理态度不同：过失投毒罪不是故意在食品中掺入有毒、有害的非食品原料，而是由于疏忽大意或过于自信造成的;而本罪则是故意在食品中掺入有毒、有害的非食品原料。具体言之，完全因为过失而将有毒、有害的物质掺入食品当中的，应当认定为过失投毒罪;明知是有毒、有害的物质而故意掺入食品当申，但又不具故意投毒的目的，应认定为生产、销售有毒、有害食品罪。另外，本罪可由自然人或单位构成，但投毒罪只能由自然人构成。
本罪与重大责任事故罪和玩忽职守罪的界限
区别关键往于主观方面不同：本罪是在生产、销售的食品中故意掺入有毒、有害的非食品原料或销售明知掺有有毒、有害的非食品原料的食品;而重大责任事故罪和玩忽职守罪对食品中掺入有毒、有害的非食品原料主观上既非故意，又非明知。
生产、销售有毒、有害食品罪立案标准2022在生产、销售的食品中掺入有毒、有害的非食品原料的，或者销售明知掺有有毒、有害的非食品原料的食品的，应予立案追诉。
在食品加工、销售、运输、贮存等过程中，掺入有毒、有害的非食品原料，或者使用有毒、有害的非食品原料加工食品的，应予立案追诉。
在食用农产品种植、养殖、销售、运输、贮存等过程中，使用禁用农药、兽药等禁用物质或者其他有毒、有害物质的，应予立案追诉。
在保健食品或者其他食品中非法添加国家禁用药物等有毒、有害物质的，应予立案追诉。
下列物质应当认定为本条规定的“有毒、有害的非食品原料”：
(一)法律、法规禁止在食品生产经营活动中添加、使用的物质;
(二)国务院有关部门公布的《食品中可能违法添加的非食用物质名单》《保健食品中可能非法添加的物质名单》中所列物质;
(三)国务院有关部门公告禁止使用的农药、兽药以及其他有毒、有害物质;
(四)其他危害人体健康的物质。
2022生产、销售有毒、有害食品罪量刑标准生产、销售有毒、有害食品罪在生产、销售的食品中掺入有毒、有害的非食品原料的，或者销售明知掺有有毒、有害的非食品原料的食品的，处五年以下有期徒刑，并处罚金;对人体健康造成严重危害或者有其他严重情节的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金;致人死亡或者有其他特别严重情节的，依照本法第一百四十一条的规定处罚。
1.具有下列情形之一的，应当认定为“对人体健康造成严重危害”：
(一)造成轻伤以上伤害的;
(二)造成轻度残疾或者中度残疾的;
(三)造成器官组织损伤导致一般功能障碍或者严重功能障碍的;
(四)造成十人以上严重食物中毒或者其他严重食源性疾病的;
(五)其他对人体健康造成严重危害的情形。
2.具有下列情形之一的，应当认定为“其他严重情节”：
(一)生产、销售金额二十万元以上不满五十万元的;
(二)生产、销售金额十万元以上不满二十万元，有毒、有害食品的数量较大或者生产、销售持续时间较长的;
(三)生产、销售金额十万元以上不满二十万元，属于婴幼儿食品的;
(四)生产、销售金额十万元以上不满二十万元，一年内曾因危害食品安全违法犯罪活动受过行政处罚或者刑事处罚的;
(五)有毒、有害的非食品原料毒害性强或者含量高的;
(六)其他情节严重的情形。
3.生产、销售有毒、有害食品，生产、销售金额五十万元以上，或者具有下列情形之一的，应当认定为刑法第一百四十四条规定的“致人死亡或者有其他特别严重情节”。
(一)致人死亡或者重度残疾的;
(二)造成三人以上重伤、中度残疾或者器官组织损伤导致严重功能障碍的;
(三)造成十人以上轻伤、五人以上轻度残疾或者器官组织损伤导致一般功能障碍的;
(四)造成三十人以上严重食物中毒或者其他严重食源性疾病的;
(五)其他特别严重的后果。