建议先办理离婚登记，后去法院申请撤诉。
既然被告同意协议离婚了，那还等什么，赶紧起草离婚协议去民政局领取离婚证。防止对方反悔。领取离婚证之后，联系法官办理撤诉手续。
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（备注：去民政局时，如果被问及是否起诉离婚，要答否，要不然可能会让去法院解决）
还有一种办法，
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联系法官，让法官按照你们协议的内容出具调解书。如果协议内容合法，法官会出具调解书的，拿到调解书之后，就算离婚了，不需要再去民政局领取离婚证。
调解书的好处是具有强制执行力，如果一方不履行调解书中的义务，另一方可以直接申请法院强制执行。
如果先撤诉，再去办理离婚证，万一撤诉之后对方又不同意离婚了呢？只能等到6个月之后才能再次起诉。
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这种情况下就是被算计了。
法律依据：
《民事诉讼法司法解释》第二百一十四条
原告撤诉或者人民法院按撤诉处理后，原告以同一诉讼请求再次起诉的，人民法院应予受理。
原告撤诉或者按撤诉处理的离婚案件，没有新情况、新理由，六个月内又起诉的
，比照民事诉讼法第一百二十四条第七项的规定
不予受理。
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