存单质押是指借款人以贷款银行签发的未到期的个人本外币定期储蓄存单作为质押。存单质押被法院冻结是合理的。根据法律规定，人民法院依法可以对银行承兑汇票保证金采取冻结措施，但不得扣划。虽然另有规定担保物权人依法享有就担保财产优先受偿的权利，但这并不意味着排除其他债权人的权利。
【法律依据】
《民法典》第四百二十五条，为担保债务的履行，债务人或者第三人将其动产出质给债权人占有的，债务人不履行到期债务或者发生当事人约定的实现质权的情形，债权人有权就该动产优先受偿。前款规定的债务人或者第三人为出质人，债权人为质权人，交付的动产为质押财产。